Alfredo Pérez Rubalcaba 1951n jaio zen, Solaresen (Kantabria). Alfredo Pérez eta María Dolores Rubalcaba ziren haren gurasoak. Bera txikia zela, Madrilera joan ziren bizitzera. Pilar ikastetxean eta Unibertsitate Konplutentseko Kimika Fakultatean egin zituen ikasketak, eta hor doktoratu zen, 1978an, aparteko saria eskuratuta, erreakzio organikoetako estereoselektibitateari buruzko tesi batekin. 1979an, Pilar Goyarekin ezkondu zen; unibertsitatean ezagutu zuten elkar.
Unibertsitatea, atletismoa eta lehen urrats politikoak
Oso laster, zaletasun zituen hiru jarduera uztartu zituen: Kimikako irakaskuntza, politika eta atletismoa. 1974an, irakaskuntzan hasi zen, Kimika Organikoko irakasle, eta ikerketa-lanari ere ekin zion, zeina Konstantzako (Alemania) eta Montpellierko (Frantzia) unibertsitateetan osatu zuen. Unibertsitateko lana bete zuen ardura arretatsu berarekin aritu zen atletismoan, abiadura-modalitatean. Berehala, baina, lesio batek aurrera egitea eragotzi zion, baina ordurako, 1971n, 100 metro 10,9 segundoan korritzea lortu zuen, eta urtebete geroago, 200 metro 22,4 segundoan. Marka bikainak kirolari unibertsitario batentzat, eta beti oso harro agertu zen marka horietaz. Bizitza osoan maite izan zuen kirola, atletismoa eta futbola bereziki, eta, espiritu analitiko eta arrazionalarekin batera, ez zuen inoiz ezkutatu Real Madrilen aldeko grina.
100 metro 10,9 segundoan; unibertsitateko kirolari batentzat marka oso ona
1974an, politikan ere hasi zen, unibertsitatearen barruan eta kanpoan. Arlo akademikoan irakasle ez-numerarioen (IEN) mugimenduaren erreferente bihurtu zen laster. Talde horren lan-eskubideen alde borrokatu zen, unibertsitatearen autonomiaren alde egin zuen, eta gizarte osoaren demokrazia- eta askatasun-eskaeretan parte hartzen zuen. Urte hartan bertan PSOEn afiliatu zen, eta Irakaskuntza eta Ikerketako batzorde sektorialetan parte hartu zuen.